一、清洗檸檬
檸檬是制作蜂蜜檸檬水主要材料之一，由于檸檬是帶皮(檸檬皮富含維生素、果膠及多酚類物質)沖泡的，因此制作蜂蜜檸檬水的第一步是將檸檬清洗干凈，具體方法是先用鹽水浸泡10～15分鐘，然后再用硬毛刷將表面刷洗干凈，尤其是檸檬表皮上的那一層蠟質。
二、溫水沖泡
檸檬清洗干凈后便可用來沖檸檬水了，在沖泡檸檬水時一般有兩種方法，第一種是先將檸檬切成薄片后再用60℃的溫開水沖泡，第二種是先將檸檬榨成檸檬汁后再用40℃的溫開水調勻，另外如果是購買的干檸檬片也可先用溫水清洗干凈后再用60℃的溫開水沖泡。
三、加入蜂蜜
加入蜂蜜是做蜂蜜檸檬水的最后一步，這一步雖然看似非常簡單，實際上也是很有學問的，其一是蜂蜜的量不能過多，否則可能因攝入糖分過多而影響蜂蜜檸檬水的效果，其二是選用的蜂蜜最好是自然成熟蜜，事實上只有自然成熟的蜂蜜才算得上是真正的蜂蜜。
四、正確飲用
蜂蜜檸檬水在飲用上也是大有門道的，其一是蜂蜜檸檬水不能空腹飲用，否則易因胃酸過多而導致胃腸疾病，最佳飲用時間是飯后1～2小時，其二是蜂蜜檸檬水不能過量飲用，長期過量飲用往往會適得其反，另外胃酸過多或胃腸病的人群最好不要喝蜂蜜檸檬水。
注意：蜂蜜檸檬水在制作時有兩個點要注意，第一點是絕對不能用開水沖泡，否則做出來蜂蜜檸檬水在營養上將大打折扣，第二點是檸檬和蜂蜜都必須適量，過量食用檸檬和蜂蜜對身體都沒好處。
